1986年，祁東縣11個(gè)區(qū)、1個(gè)區(qū)級(jí)鎮(zhèn)、1個(gè)區(qū)級(jí)林場(chǎng)和61個(gè)鄉(xiāng)鎮(zhèn)。其中洪橋區(qū)轄青山、洪豐、洪橋、白鶴鋪、馬頭、紫沖等6個(gè)鄉(xiāng)，金橋區(qū)轄金橋鎮(zhèn)、新橋頭鄉(xiāng)、官山鄉(xiāng)、鳴鹿鄉(xiāng)、羅云鄉(xiāng)等5個(gè)鄉(xiāng)鎮(zhèn)，河洲區(qū)轄河洲鎮(zhèn)、五家圍鄉(xiāng)、樟木塘鄉(xiāng)、糧市鄉(xiāng)等4個(gè)鄉(xiāng)鎮(zhèn)，歸陽(yáng)區(qū)轄歸陽(yáng)鎮(zhèn)、丁字鄉(xiāng)、鳥(niǎo)江鄉(xiāng)、三沖鄉(xiāng)、七碗鄉(xiāng)等5個(gè)鄉(xiāng)鎮(zhèn)，過(guò)水坪區(qū)轄過(guò)水坪鎮(zhèn)、百吉鄉(xiāng)、會(huì)塘鄉(xiāng)、姊妹嶺鄉(xiāng)、大同市鄉(xiāng)、大興鄉(xiāng)等6個(gè)鄉(xiāng)鎮(zhèn)，雙橋區(qū)轄雙橋鎮(zhèn)、金盆鄉(xiāng)、大云市鄉(xiāng)、靈官鄉(xiāng)等4個(gè)鄉(xiāng)鎮(zhèn)，白地市區(qū)轄白地市鎮(zhèn)、風(fēng)石堰鎮(zhèn)、元里坪鄉(xiāng)、花屋鄉(xiāng)、毛坪鄉(xiāng)、楓樹(shù)山鄉(xiāng)、萬(wàn)福嶺鄉(xiāng)、馬杜橋鄉(xiāng)等8個(gè)鄉(xiāng)鎮(zhèn)，黃土鋪區(qū)轄黃土鋪鎮(zhèn)、官家嘴鎮(zhèn)、三星鄉(xiāng)、石亭子鄉(xiāng)、梅塘鄉(xiāng)、上升鄉(xiāng)、草源沖鄉(xiāng)等7個(gè)鄉(xiāng)鎮(zhèn)，步云橋區(qū)轄步云橋鎮(zhèn)、攸陂鄉(xiāng)、雙江鄉(xiāng)、磚塘鄉(xiāng)、 包圣殿鄉(xiāng)、喬木堂鄉(xiāng)、拔茅沖鄉(xiāng)等7個(gè)鄉(xiāng)鎮(zhèn)，蔣家橋區(qū)轄蔣家橋鎮(zhèn)、祖山灣鄉(xiāng)、小坪鄉(xiāng)、鳳歧坪鄉(xiāng)等4個(gè)鄉(xiāng)鎮(zhèn)，太和堂區(qū)轄太和堂鎮(zhèn)、紫云橋鄉(xiāng)、羅口町鄉(xiāng)、三口灣鄉(xiāng)、城連墟鄉(xiāng)等5個(gè)鄉(xiāng)鎮(zhèn)，城關(guān)鎮(zhèn)為區(qū)級(jí)鎮(zhèn)，四明山林場(chǎng)與四明山鄉(xiāng)合一。  

1990年，湖南省民政廳批準(zhǔn)：丁字鄉(xiāng)福羅村劃歸歸陽(yáng)鎮(zhèn)；撤銷(xiāo)白鶴鋪鄉(xiāng)，設(shè)白鶴鋪鎮(zhèn)；撤銷(xiāo)靈官鄉(xiāng)，設(shè)靈官鎮(zhèn)；撤銷(xiāo)鳥(niǎo)江鄉(xiāng)，設(shè)鳥(niǎo)江鎮(zhèn)。

1995年，湖南省實(shí)行撤區(qū)并鄉(xiāng)建鎮(zhèn)。是年4月，省民政廳批復(fù),撤銷(xiāo)河洲、歸陽(yáng)、金橋、過(guò)水坪、雙橋、白地市、黃土鋪、步云橋、蔣家橋、太和堂、洪橋等11個(gè)區(qū)建制，保留馬杜橋、鳳歧坪、城連墟、四明山等4個(gè)鄉(xiāng)的行政區(qū)劃，將其余59個(gè)鄉(xiāng)鎮(zhèn)并為16個(gè)鎮(zhèn)、3個(gè)鄉(xiāng)（糧市、石亭子、磚塘）。同年5月，省民政廳批準(zhǔn)糧市鄉(xiāng)、石亭子鄉(xiāng)、磚塘鄉(xiāng)撤鄉(xiāng)建鎮(zhèn)。全縣改設(shè)為23個(gè)鄉(xiāng)鎮(zhèn)，其中建制鎮(zhèn)19個(gè)、鄉(xiāng)4個(gè)。

2014年根據(jù)全縣經(jīng)濟(jì)發(fā)展需要原洪橋鎮(zhèn)改為洪橋街道、白鶴鋪鎮(zhèn)改為白鶴街道、新設(shè)立玉合街道和永昌街道四個(gè)街道辦事處；原四明山鄉(xiāng)改立四明山國(guó)家森林公園管理處。至此，縣內(nèi)共有1個(gè)管理處、3個(gè)鄉(xiāng)、4個(gè)街道、17個(gè)鎮(zhèn)。

2021年12月，為加強(qiáng)對(duì)濕地公園的規(guī)劃、建設(shè)與管理，掛牌成立了湖南省祁東縣杳湖省級(jí)濕地公園管理處。至此，縣內(nèi)共有2個(gè)管理辦事處3個(gè)鄉(xiāng)4個(gè)街道17個(gè)鎮(zhèn)。